不管是對玉米進行初加工還是深度加工，都需要先出去原料中的雜質，玉米從收獲到加工都需要經過很多環節，在玉米深加工機械的過程中會混入很多的鐵釘、螺絲以及螺母等各種金屬物，如果不及時將這些金屬物清除掉，就會隨著玉米粒進入到玉米深加工機械中嚴重破壞機器，還可能會因為碰撞等產生一些火花，導致最終發生粉塵爆炸事故。另外在玉米深加工機械的加工過程中，因為設備的損壞或者氧化， 其中也會產生一些金屬碎屑或者粉末。
如果這些雜質經過玉米深加工機械混入到玉米成品中，制成的食品會嚴重危害人們的身體健康。混入到副產品中，作為飼料也會影響最終牲畜的飼養。玉米深加工機械的磁選法主要用于除去玉米籽粒中的磁性金屬雜質，保證生產線的安全進行。

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